Sephyroth y los genes de JENOVA.

Cuando el poderoso monopolio mundial de Shinra Inc. encontró en el norte del mundo los restos de una antigua criatura, creyeron que se trataba de un "Cetra", raza antigua con poderes mágicos que alguna vez habitó el mundo. En ese momento ShinraVFGF estaba preparando su raza de súpersoldados o SOLDIER (SOLDADO), y fueron iniciados dos proyectos de bioingeniería que buscarían medir los efectos de las células de la criatura JENOVA en un feto aún no nato.

Sephiroth es el resultado del "Proyecto S" en el cual el doctor a cargo de la investigación Hojo y su mujer Lucrecia inyectaron al feto con las células de JENOVA. Sephiroth fue dado a luz y fue percibido por su madre como un monstruo ya que empezó a tener sueños en los que veía los terribles actos que llevaría a cabo su hijo.

Sephiroth demostró grandes poderes y habilidades y rápidamente llegó a los altos rangos de SOLDADO junto con Genesis, el resultado del "Proyecto G". Aún cuando ambos proyectos eran muy similares en su concepción, Sephiroth y Genesis eran muy diferentes biológicamente, y mientras que los poderes de Genesis iban deteriorándose, los de Sephiroth iban aumentando.

Sephiroth se hizo del rango de SOLDADO de Primera Clase antes de la guerra de Shinra contra la nación de Wutai. Se había vuelto tan poderoso que cláusulas especiales de reserva debían ser mantenidas por la organización en caso que él decidiera cambiar de bando. Sin embargo, Sephiroth demostró todo su poder en la guerra contra Wutai, y junto a otros soldados como Zack Fair, puso fin rápidamente a la guerra permitiéndole a Shinra el convertirse en el gobierno mundial de facto.

Desde el momento en que acabó la guerra y fué cobrando conocimiento de lo que pasaba, Sephiroth recurrió a los poderes oscuros,los cuales lo harían mas poderoso todavía, para alcanzar su meta: volver a ser parte de JENOVA y juntos, conseguir que el meteorito de los Ancestros impactase en la Tierra y con ello acabar con la especie ansiosa de poseer las corrientes vitales del planeta.

Después del impacto de Meteorito en la Tierra, Sephiroth aparentemente fué absorvido por la corriente vital del planeta, pero se sabe que el genoma de JENOVA sigue vivo y con ello Sephiroth y esque, SEPHIROTH NUNCA PUEDE MORIR.